| Type de document : |
texte imprimé |
| Auteurs : |
Roux Magali ECRIN |
| Editeur : |
Paris : Omniscience |
| Année de publication : |
2007 |
| Importance : |
288 p |
| Format : |
22,5 cm |
| Langues : |
Français (fre) |
| Mots-clés : |
MIAME, MAGE et transcriptome - MIAPE, PSI et prot?omique - XML, RDF, OWL langages de description et d'?changes de donn?es - BFO pour la standardisation des ontologies biom?dicales OBO - GO annotation fonctionnelle |
| Index. décimale : |
570 |
| Résumé : |
La biologie syst?mique est une nouvelle approche interdisciplinaire de la biologie qui ?largit le champ de la biologie mol?culaire pour ?tudier des ensembles d'?l?ments en interaction les uns avec les autres, c'est-?-dire des syst?mes de mol?cules (ADN, prot?ines, complexes mol?culaires, ?difices supramol?culaires, petites mol?cules, etc.). Pour observer simultan?ment tous ces syst?mes d'?l?ments, la biologie syst?mique a recours aux diff?rents domaines de la biologie ? haut d?bit (g?nomique, transcriptomique, prot?omique, m?tabolomique, etc.). Face ? ce d?luge d'information, sa premi?re vocation est de r?aliser l'int?gration des donn?es dans des mod?les conceptuels. L'objet de tels mod?les est d'expliquer les m?canismes de fonctionnement des syst?mes ?tudi?s et de pr?dire leur comportement et leur ?volution. Pour r?pondre au d?fi de la biologie syst?mique, et afin de faciliter et d'assurer un meilleur partage des donn?es entre chercheurs, la communaut? scientifique internationale a engag? diff?rentes initiatives de standardisation. Cet ouvrage pionnier a ?t? r?dig? par plus de 25 sp?cialistes internationaux. Il traite, en 12 chapitres, des enjeux de ces proc?dures de standardisation : standardisation des domaines technologiques (transcriptome, prot?ome, etc.), standardisation des langages (ontologies, langages d'?change, langages sp?cifiques de domaine), standardisation des formalismes de repr?sentation (graphiques, math?matiques), etc. La " preuve du concept " est illustr?e, notamment, par le mod?le de la cellule cardiaque et par son application au traitement de l'arythmie. Enfin, une th?orie de l'int?gration bas?e sur l'ing?nierie dirig?e par les mod?les (IDM) fournit les outils n?cessaires pour organiser les mod?les multivue, multi?chelle, multirepr?sentation et multiformalisme qui rendent compte de la complexit? des syst?mes biologiques. |
| En ligne : |
570-09.1.pdf |
[texte imprimé] / Roux Magali ECRIN . - Paris : Omniscience, 2007 . - 288 p ; 22,5 cm. Langues : Français ( fre)
| Mots-clés : |
MIAME, MAGE et transcriptome - MIAPE, PSI et prot?omique - XML, RDF, OWL langages de description et d'?changes de donn?es - BFO pour la standardisation des ontologies biom?dicales OBO - GO annotation fonctionnelle |
| Index. décimale : |
570 |
| Résumé : |
La biologie syst?mique est une nouvelle approche interdisciplinaire de la biologie qui ?largit le champ de la biologie mol?culaire pour ?tudier des ensembles d'?l?ments en interaction les uns avec les autres, c'est-?-dire des syst?mes de mol?cules (ADN, prot?ines, complexes mol?culaires, ?difices supramol?culaires, petites mol?cules, etc.). Pour observer simultan?ment tous ces syst?mes d'?l?ments, la biologie syst?mique a recours aux diff?rents domaines de la biologie ? haut d?bit (g?nomique, transcriptomique, prot?omique, m?tabolomique, etc.). Face ? ce d?luge d'information, sa premi?re vocation est de r?aliser l'int?gration des donn?es dans des mod?les conceptuels. L'objet de tels mod?les est d'expliquer les m?canismes de fonctionnement des syst?mes ?tudi?s et de pr?dire leur comportement et leur ?volution. Pour r?pondre au d?fi de la biologie syst?mique, et afin de faciliter et d'assurer un meilleur partage des donn?es entre chercheurs, la communaut? scientifique internationale a engag? diff?rentes initiatives de standardisation. Cet ouvrage pionnier a ?t? r?dig? par plus de 25 sp?cialistes internationaux. Il traite, en 12 chapitres, des enjeux de ces proc?dures de standardisation : standardisation des domaines technologiques (transcriptome, prot?ome, etc.), standardisation des langages (ontologies, langages d'?change, langages sp?cifiques de domaine), standardisation des formalismes de repr?sentation (graphiques, math?matiques), etc. La " preuve du concept " est illustr?e, notamment, par le mod?le de la cellule cardiaque et par son application au traitement de l'arythmie. Enfin, une th?orie de l'int?gration bas?e sur l'ing?nierie dirig?e par les mod?les (IDM) fournit les outils n?cessaires pour organiser les mod?les multivue, multi?chelle, multirepr?sentation et multiformalisme qui rendent compte de la complexit? des syst?mes biologiques. |
| En ligne : |
570-09.1.pdf |
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