Bioinformatique de la sequence a la structure des proteines : cours et cas pratiques [texte imprimé] /
Deleage Gilbert ;
et autres . -
DUNOD, 3.Ed-2021 . - 226 pages ; 24 x 17 cm.
ISBN : 978-2-10-081515-9
Sommaire:
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Avant-propos
Chapitre 1. La composition en acides aminés
Chapitre 2. Bases de données pour données de bases
Chapitre 3. La comparaison de deux séquences
Chapitre 4. Recherche dans les banques
Chapitre 5. Alignement de séquences
Chapitre 6. Bases théoriques de la phylogénie moléculaire
Chapitre 7. Algorithmes pour la phylogénie moléculaire
Chapitre 8. Recherche de fonctions
Chapitre 9. Profils physico-chimiques
Chapitre 10. Prédictions de structures secondaires
Chapitre 11. Structures 3D
Chapitre 12. Modélisation de structures 3D
Chapitre 13. Détection de sites 3D dans les protéines
Cas pratique d’analyse de séquences
Cas pratique de modélisation moléculaire de protéine par homologie
Conclusion
Bibliographie
Glossaire
Index.
Langues : Français (
fre)
| Mots-clés : |
informatique les protéines acides aminés Bases de données Matrice la phylogénie moléculaire les physico-chimiques SOPM SOPMA GOR NNM Structures 3D Modélisation de structures les sites |
| Résumé : |
La bioinformatique a pour but d'intégrer des données d'origines très diverses pour modéliser les systèmes vivants afin de comprendre et prédire leurs comportements [analyse du génome, modélisation de l'évolution d'une population animale, modélisation moléculaire, reconstruction d'arbres phylogénétiques...). Ce livre est axé sur la bioinformatique des protéines. Il aborde de manière simple les tâches courantes qu'un biologiste ou un biochimiste doit savoir traiter sans avoir recours au spécialiste.
Cette nouvelle édition a été enrichie de nouvelles notions comme les réseaux de neurones, les machines à vecteurs de supports, l'apprentissage profond et les alphabets structuraux. Les plus : les méthodes, algorithmes et implémentations les plus courants ; des cas pratiques détaillés. Sommaire : la composition en acides aminés ; bases de données pour données de bases ; la comparaison de deux séquences ; recherche dans les banques ; alignement de séquences ; bases théoriques de la phylogénie moléculaire ; algorithmes pour la phylogénie moléculaire ; recherche de fonctions ; profils physico-chimiques ; prédictions de structures secondaires ; structures 3D ; modélisation de structures 3D ; détection de sites 3D dans les protéines ; cas pratique d'analyse de séquences ; cas pratique de modélisation moléculaire de protéine par homologie. |
Bioinformatique de la sequence a la structure des proteines
